Sposób, w jaki analizujemy mikrobiom - niewidoczne społeczności bakterii zamieszkujące jelita - ma ogromny wpływ na identyfikację kluczowych mikroorganizmów dla danej choroby – wynika z badań przeprowadzonych przez polsko-estoński zespół, w składzie którego są naukowcy z Uniwersytetu Jagiellońskiego.
Jak poinformowało w piątek biuro prasowe UJ, badania związane z ustanowieniem wytycznych dotyczących lepszego wykorzystania danych mikrobiomu w diagnostyce chorób przeprowadził zespół z Sano - Centrum Medycyny Obliczeniowej, Małopolskiego Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego i Uniwersytetu w Tartu. Ich wyniki zostały właśnie opublikowane w czasopiśmie Microbiome.
Autorzy zastosowali algorytmy uczenia maszynowego oraz różne techniki transformacji danych do analizy ponad 8,5 tys. próbek pochodzących z 24 różnych zestawów danych mikrobiomu jelit. Celem ich pracy było poprawienie precyzji w rozróżnianiu profili bakterii jelitowych między stanami zdrowia a chorobami, a także uzyskanie głębszego wglądu w to, jak wybór metod analitycznych wpływa na identyfikację kluczowych bakterii.
Zdaniem autorów badania mikrobioty jelitowej pokazują, że zmiany w jej składzie mogą działać jako naturalne biomarkery; np. określone wzorce w mikrobiomie - zwiększona obfitość niektórych bakterii lub brak innych - mogą wskazywać na wystąpienie poważnych schorzeń, zanim jeszcze pacjent zauważy jakiekolwiek objawy.
„To jak system wczesnego ostrzegania, który może wykryć problemy zdrowotne, zanim pojawią się jakiekolwiek objawy. Nowotwory jelita grubego i trzustki są godnymi uwagi przykładami, w których mikrobiom może poprawić diagnostykę chorób” - zaznaczyli naukowcy.
Metody oparte na diagnostyce mikrobiomu – wskazali w swojej pracy - są mniej inwazyjne i uciążliwe dla pacjentów, oferując nową jakość w medycynie prewencyjnej.
Eksperci wskazali także na pilną potrzebę standaryzacji metod analizy mikrobiomu, co w połączeniu z mocą sztucznej inteligencji może zmienić sposób, w jaki mikrobiom jest rozumiany i wykorzystywany w medycynie.(PAP)
Nauka w Polsce
rgr/ bar/
Fundacja PAP zezwala na bezpłatny przedruk artykułów z Serwisu Nauka w Polsce pod warunkiem mailowego poinformowania nas raz w miesiącu o fakcie korzystania z serwisu oraz podania źródła artykułu. W portalach i serwisach internetowych prosimy o zamieszczenie podlinkowanego adresu: Źródło: naukawpolsce.pl, a w czasopismach adnotacji: Źródło: Serwis Nauka w Polsce - naukawpolsce.pl. Powyższe zezwolenie nie dotyczy: informacji z kategorii "Świat" oraz wszelkich fotografii i materiałów wideo.